36 tahun setelahnya, ia kembali mengisi film yang kali ini digarap oleh Joseph Konsinski ini bersama dengan aktor lainnya seperti Jennifer Connelly, Jon Hamm, Glen Powell, Lewis Pullman, Ed Harris, Monica Barbaro, dan Miles Teller dalam Top Gun: Maverick.
Sekuel yang memakan waktu lebih dari tiga dekade dan masih menunjuk Maverick sebagai kaptennya. Ia ditugaskan untuk kembali ke Fighter Weapons School untuk misi khusus melatih detasemen lulusan Top Gun.
Dalam kehidupan nyatanya, Cruise mengembangkan program pelatihan untuk para pemain Top Gun 2 yang lebih muda, ia mengajari mereka untuk menerbangkan helikopter F/A-18s, memegang kendali Gs, dan sering mengoperasikan kamera di kokpitnya.
Top Gun: Maverick menampilkan banyak adegan aviasi yang praktikal, dengan para krunya membangun kamera baru agar dapat merekam aksi penerbangan secara lebih proper.